A trama se passa 10 anos após os acontecimentos de Basilisk Kouga Ninpouchou, que estreou no ano de 2005 produzido pelo estúdio Gonzo (Afro Samurai).
A história anterior acompanha a guerra entre os clãs ninjas Kouga e Iga no Japão Feudal , após o governante da dinastia real Tokugawa ordenar que esse confronto definiria qual dos seus filhos seria o próximo sucessor ao trono. Trailer a seguir